Uma alteração relativamente comum apresentada pelos cães é a inflamação intestinal crônica. Se trata daquele paciente que frequentemente apresenta alterações nas fezes, coco mole, com muco e em alguns casos com sangue. Estudos recentes demonstram que 60 a 70% dos casos avaliados obteve uma melhora significativa quando adaptada a alimentação utilizando uma dieta especifica. Nesses casos, pode-se utilizar uma dieta com uma proteína hidrolisada ou uma proteína nunca ingerida pelo paciente anteriormente. Essa adaptação apresenta melhora em até 2 semanas. Segundo o estudo, a prescrição deve ser mantida por no mínimo 21 semanas e após esse período o paciente pode voltar a dieta anterior.
Os casos que não respondem a troca alimentar podem necessitar de antibióticos, porém cada caso deve ser criteriosamente avaliado pelo médico veterinário.